La chiesa di San Martino è legata alle origini della comunità di Morbegno. Documentata dal sec. XII, con la cappella di Santa Maria di Talamona, divenne autonoma dalla pieve di Ardenno sul finire del secolo XII, in quanto appartenente al monastero comasco di S. Abbondio, come conferma un successivo atto del 1208. Fu quindi la prima chiesa parrocchiale di Morbegno, gradualmente sostituita, per la sua lontananza dal borgo, dalla chiesa di S. Pietro nel Trecento e, successivamente, dalla chiesa cinquecentesca di S. Giovanni Battista e poi dall’attuale.

Alla chiesa di S.  Martino rimase sempre legato il culto dei defunti sepolti nel cimitero circostante, tanto che venne “reffatta tutta di novo l'anno 1566 con tre navi et quattro collonne" (F. Ninguarda). 

L’edificio si presenta all'esterno di dimensioni ridotte in altezza, con copertura a capanna che comprende il portico davanti alla facciata a tre arcate sostenute da pilastri (di cui si parla per la prima volta nel 1718). Alle massicce pareti rimangono affisse lapidi mortuarie che rendono ancor più evidente l'inserimento della chiesa nell'ambiente cimiteriale circostante, dove sono raccolte piccole tombe fra le quali si eleva, a nord-est, una grande, croce in ferro, secondo le prescrizioni post-tridentine, a cui sono appesi gli strumenti che ricordano la passione. 

Sulla facciata della chiesa, semplicemente scandita da due lesene, si conserva a sinistra un piccolo affresco che rappresenta S.Martino a cavallo che dona il mantello a1 povero (di fattura rinascimentale), mentre è scomparso coi restauri degli anni Novanta un analogo affresco settecentesco con S. Giorgio e il drago.